MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 62970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021081	CG	3	6	274353	274358	0 %	0 %	50 %	50 %	482881912
5502	NC_021081	GC	3	6	274365	274370	0 %	0 %	50 %	50 %	482881912
5503	NC_021081	TGC	2	6	274429	274434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881912
5504	NC_021081	TTAG	2	8	274488	274495	25 %	50 %	25 %	0 %	482881912
5505	NC_021081	AGGA	2	8	274530	274537	50 %	0 %	50 %	0 %	482881912
5506	NC_021081	TTGG	2	8	274597	274604	0 %	50 %	50 %	0 %	482881913
5507	NC_021081	TA	3	6	274629	274634	50 %	50 %	0 %	0 %	482881913
5508	NC_021081	CTG	2	6	274697	274702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881913
5509	NC_021081	CTTT	2	8	274715	274722	0 %	75 %	0 %	25 %	482881913
5510	NC_021081	GGT	2	6	274816	274821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881913
5511	NC_021081	CTG	2	6	274823	274828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881913
5512	NC_021081	TGG	2	6	274908	274913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881913
5513	NC_021081	T	7	7	274930	274936	0 %	100 %	0 %	0 %	482881913
5514	NC_021081	TGC	2	6	274999	275004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881913
5515	NC_021081	AAG	2	6	275137	275142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881913
5516	NC_021081	GGT	2	6	275194	275199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881913
5517	NC_021081	TTA	2	6	275235	275240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482881913
5518	NC_021081	TGG	2	6	275250	275255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881913
5519	NC_021081	GGC	2	6	275274	275279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881913
5520	NC_021081	TTTC	2	8	275282	275289	0 %	75 %	0 %	25 %	482881913
5521	NC_021081	TTTGG	2	10	275303	275312	0 %	60 %	40 %	0 %	482881913
5522	NC_021081	G	7	7	275387	275393	0 %	0 %	100 %	0 %	482881913
5523	NC_021081	TTTG	2	8	275479	275486	0 %	75 %	25 %	0 %	482881913
5524	NC_021081	TGC	2	6	275497	275502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881913
5525	NC_021081	TGC	2	6	275634	275639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881913
5526	NC_021081	TCTGAT	2	12	275671	275682	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	482881913
5527	NC_021081	ATG	2	6	275786	275791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881913
5528	NC_021081	GAA	2	6	276182	276187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881914
5529	NC_021081	TGG	2	6	276193	276198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881914
5530	NC_021081	CTGAT	2	10	276283	276292	20 %	40 %	20 %	20 %	482881914
5531	NC_021081	TTG	2	6	276450	276455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881914
5532	NC_021081	CGA	3	9	276518	276526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881914
5533	NC_021081	GCTG	2	8	276533	276540	0 %	25 %	50 %	25 %	482881914
5534	NC_021081	TTC	2	6	276581	276586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881914
5535	NC_021081	CAG	2	6	276612	276617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881914
5536	NC_021081	GGT	2	6	276626	276631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881914
5537	NC_021081	CGC	2	6	276647	276652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881914
5538	NC_021081	GGT	3	9	276695	276703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881914
5539	NC_021081	G	7	7	276745	276751	0 %	0 %	100 %	0 %	482881914
5540	NC_021081	GAG	2	6	276792	276797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881914
5541	NC_021081	CGG	2	6	276805	276810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881914
5542	NC_021081	GGC	2	6	276818	276823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881914
5543	NC_021081	AGGCCC	2	12	276853	276864	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	482881914
5544	NC_021081	GCA	2	6	276881	276886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881914
5545	NC_021081	CTG	2	6	276948	276953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881914
5546	NC_021081	GAGG	2	8	276954	276961	25 %	0 %	75 %	0 %	482881914
5547	NC_021081	CAG	2	6	277004	277009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881915
5548	NC_021081	CT	3	6	277277	277282	0 %	50 %	0 %	50 %	482881915
5549	NC_021081	TGCC	2	8	277410	277417	0 %	25 %	25 %	50 %	482881915
5550	NC_021081	CCG	2	6	277444	277449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881915
5551	NC_021081	CCG	2	6	277510	277515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881915
5552	NC_021081	ATCA	2	8	277526	277533	50 %	25 %	0 %	25 %	482881915
5553	NC_021081	GAG	2	6	277562	277567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881915
5554	NC_021081	CAA	2	6	277604	277609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881915
5555	NC_021081	CTG	2	6	277709	277714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881915
5556	NC_021081	G	6	6	277728	277733	0 %	0 %	100 %	0 %	482881915
5557	NC_021081	GAG	2	6	277778	277783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881915
5558	NC_021081	GGT	2	6	277803	277808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881915
5559	NC_021081	GAT	2	6	277825	277830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881915
5560	NC_021081	TAC	2	6	278301	278306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881916
5561	NC_021081	TCT	2	6	278381	278386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881916
5562	NC_021081	AGCA	2	8	278390	278397	50 %	0 %	25 %	25 %	482881916
5563	NC_021081	GGC	2	6	278441	278446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881916
5564	NC_021081	CCG	2	6	278490	278495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881916
5565	NC_021081	CCA	2	6	278547	278552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881916
5566	NC_021081	AACC	2	8	278599	278606	50 %	0 %	0 %	50 %	482881916
5567	NC_021081	TCT	2	6	278645	278650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881916
5568	NC_021081	AGCA	2	8	278654	278661	50 %	0 %	25 %	25 %	482881916
5569	NC_021081	GGC	2	6	278705	278710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881916
5570	NC_021081	CCG	2	6	278754	278759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881916
5571	NC_021081	TGCCGT	2	12	278791	278802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881916
5572	NC_021081	CCA	2	6	278811	278816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881916
5573	NC_021081	CCTA	2	8	278873	278880	25 %	25 %	0 %	50 %	482881916
5574	NC_021081	GCG	2	6	278889	278894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881916
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5578	NC_021081	CAG	2	6	279064	279069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881916
5579	NC_021081	TGG	3	9	279102	279110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881916
5580	NC_021081	TGGC	2	8	279131	279138	0 %	25 %	50 %	25 %	482881916
5581	NC_021081	ACC	2	6	279170	279175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881916
5582	NC_021081	GGCC	2	8	279199	279206	0 %	0 %	50 %	50 %	482881916
5583	NC_021081	AAG	2	6	279213	279218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881916
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5585	NC_021081	TGG	3	9	279264	279272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881916
5586	NC_021081	GCC	2	6	279294	279299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881916
5587	NC_021081	CGC	2	6	279379	279384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881916
5588	NC_021081	GTG	2	6	279398	279403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881916
5589	NC_021081	CAG	2	6	279421	279426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881916
5590	NC_021081	GGT	2	6	279538	279543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881916
5591	NC_021081	CCG	2	6	279573	279578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881916
5592	NC_021081	TA	3	6	279624	279629	50 %	50 %	0 %	0 %	482881916
5593	NC_021081	GCTCG	2	10	279667	279676	0 %	20 %	40 %	40 %	482881916
5594	NC_021081	CGC	2	6	279730	279735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881916
5595	NC_021081	CGG	2	6	279745	279750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881916
5596	NC_021081	GCCCT	2	10	279752	279761	0 %	20 %	20 %	60 %	482881916
5597	NC_021081	CAG	2	6	279821	279826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881916
5598	NC_021081	ACGGG	2	10	279924	279933	20 %	0 %	60 %	20 %	482881916
5599	NC_021081	CGG	2	6	279946	279951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881916
5600	NC_021081	AGC	2	6	279980	279985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881916
5601	NC_021081	GCC	2	6	280002	280007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881916
5602	NC_021081	TGGGC	2	10	280173	280182	0 %	20 %	60 %	20 %	482881916
5603	NC_021081	ACCA	2	8	280286	280293	50 %	0 %	0 %	50 %	482881916
5604	NC_021081	AAG	2	6	280340	280345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881916
5605	NC_021081	ACT	2	6	280682	280687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881917
5606	NC_021081	AGG	2	6	280697	280702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881917
5607	NC_021081	GCC	2	6	280703	280708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881917
5608	NC_021081	ACC	2	6	280831	280836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881917
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5610	NC_021081	GCG	2	6	280864	280869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881917
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5612	NC_021081	C	6	6	280955	280960	0 %	0 %	0 %	100 %	482881917
5613	NC_021081	CAT	2	6	280971	280976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881917
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5615	NC_021081	CAT	2	6	281016	281021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881917
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5617	NC_021081	GGC	2	6	281161	281166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881917
5618	NC_021081	G	6	6	281170	281175	0 %	0 %	100 %	0 %	482881917
5619	NC_021081	ACG	3	9	281189	281197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881917
5620	NC_021081	ACG	2	6	281243	281248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881917
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5622	NC_021081	GCTG	2	8	281282	281289	0 %	25 %	50 %	25 %	482881917
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5845	NC_021081	CCT	2	6	291365	291370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881925
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5861	NC_021081	CTA	2	6	292505	292510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881927
5862	NC_021081	CTG	2	6	292518	292523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881927
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5986	NC_021081	TGGTA	2	10	298549	298558	20 %	40 %	40 %	0 %	482881933
5987	NC_021081	CTGGC	2	10	298589	298598	0 %	20 %	40 %	40 %	482881933
5988	NC_021081	CTT	2	6	298636	298641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881933
5989	NC_021081	GCT	2	6	298690	298695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881933
5990	NC_021081	CTG	3	9	298745	298753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881933
5991	NC_021081	GGT	2	6	298810	298815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881933
5992	NC_021081	GCC	2	6	298827	298832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881933
5993	NC_021081	GCTT	2	8	298848	298855	0 %	50 %	25 %	25 %	482881933
5994	NC_021081	GGC	2	6	298918	298923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881933
5995	NC_021081	CCGATG	2	12	298947	298958	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	482881933
5996	NC_021081	GCGG	2	8	298981	298988	0 %	0 %	75 %	25 %	482881933
5997	NC_021081	CGGGC	2	10	299012	299021	0 %	0 %	60 %	40 %	482881933
5998	NC_021081	TGC	2	6	299094	299099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881933
5999	NC_021081	TCGGCG	2	12	299141	299152	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	482881933
6000	NC_021081	CGGC	2	8	299180	299187	0 %	0 %	50 %	50 %	482881933

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